由中国科学院北京基因组研究所主理的全英文学术期刊——《基因组卵白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, GPB),首批于线预揭晓(Article-in-Press)文章乐成上线。这次该刊物于线预揭晓功效的开通与使用,对于在帮忙科研职员实时揭晓本身的最新研究结果,使读者倏地相识海内外的最新研究进展,和晋升GPB期刊的影响力都将起到踊跃作用。
近日,由中国科学院北京基因组研究所主理的全英文学术期刊——《基因组卵白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics Bioinformatics, GPB),首批于线预揭晓(Article-in-Press)文章乐成上线。这次该刊物于线预揭晓功效的开通与使用,对于在帮忙科研职员实时揭晓本身的最新研究结果,使读者倏地相识海内外的最新研究进展,和晋升GPB期刊的影响力都将起到踊跃作用。
自2003年创刊的近十年来,GBP始终遵照传统定期揭晓文章的出书模式,但跟着人们对于信息时效性的需求日趋增加,为了缩漫笔章的揭晓周期,改良定期出书期刊的滞后性,从2012年6月最先,GPB将所有颠末偕行评断被接管的稿件,于ScienceDirect数据库中率先以于线预揭晓的情势提早揭晓,让文章更早地与读者晤面,供各人浏览、援用。本期首批预揭晓的7篇文章,各人可经由过程如下先容先睹为快:
1. 本刊主编在军研究员就其十五年来关在基因组转录方面的研究结果揭晓了简短评论,对于一些问题举行了更深切的思索,并对于一些传统不雅点提出了新的应战。
2. 全基因组序列阐发是生物信息学以及计较生物学研究的根蒂根基,Bilal Wajid等人对于已往数十年Genome Assembler的研究事情举行了总结,对于二代测序技能的正常算法特色举行了综述,为初学者以及感乐趣职员相识本事域提供了很好的帮忙。
3. 于在军研究员以及胡松年研究员的引导下,崔鹏、刘万飞、赵宇慧等人对于三甲基化组卵白H3赖氨酸4(H3K4me3)举行了研究。他们经由过程比力小鼠年夜脑以及睾丸构造中H3K4me三、H3K27me3的基因组图谱,发明该基因润色与构造特同性表达、功效以及发育紧密亲密相干。
4. 以上研究小组的研究还发明H3K4me3于公理基因3′端有显著富集,被称为3′-H3K4me3,3′-H3K4me3区域多是作为反义转录的潜于启动子而阐扬作用,而这一征象可能于真核生物中遍及存于。
5. 小麦白粉病是因为传染白粉病菌惹起的,可致使小麦增产。本刊编委王向峰教员与中国农业年夜学孙其信、解超杰教员等人互助,对于两种差别基因型(易感、抗病)小麦于白粉病菌传染先后的叶片举行了转录组比力研究。成果注解,抗白粉病是一种由年夜量基因介入调控的极端繁杂的体系反映。
6. 水牛是一种主要六畜,但其全基因组序列信息尚需完美。Subhash J. Jakhesara等人哄骗水牛肌肉构造来历的cDNA作探针,从其基因组中捕捉Tissue Specific Temporal外显子并举行454测序,以展现该物种的肌肉构造特同性基因����APP以及单核苷酸多态性,为研究还没有完玉成基因组测序物种的编码序列变异环境,提供了新的计谋。
7. 非编码RNA(ncRNA)于转录程度调治基因表达方面起主要作用,但仍有很多ncRNA另有待进一步被发明。Michael Bao等人研发了一种基在ab initio的寻觅基因组序列中ncRNA的新要领——ncRNAscout。与传统要领比拟,该要领因为插手了最小自由能t-scores以及SVP值这两个参数,是以能更切确地定位基因组中的ncRNA序列。该东西可于http://bioinformatics.njit.edu/ncRNAscout使用。
注:如您想浏览文章全文,请登岸GPB期刊预揭晓文章原文链接:http://www.sciencedirect.com/science/journal/aip/16720229.
/安博